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优化本科专业设置是提升人才培养质量的关键,是建设一流大学的前提。通过对美国的耶鲁大学、哥伦比亚大学、宾夕法尼亚大学以及中国的清华大学、浙江大学、厦门大学在理科本科专业设置情况分析和研究发现:由于在专业内涵的理解、拥有专业设置权的主体、社会经济与高等教育发展阶段等方面的不同,中美一流大学理科本科专业设置的规模、方式等方面表现出一定差异。我国可以从转变专业认知思维、扩大高校专业设置自主权、建立跨学科专业发展机制等方面提升人才培养质量。