马铃薯锌转运体基因StZnT2生物信息学及表达特性分析

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锌是植物生长发育所必需的微量元素,缺锌或过量锌都会严重影响植物生长,锌转运蛋白对调节植物体内锌稳态具有重要作用。本研究以马铃薯(Solanum tuberosum)栽培品种’大西洋’试管苗为实验材料,克隆得到马铃薯锌转运体2 (Solanum tuberosum zinc transporter 2, StZnT2)(GenBank No. XM_006358632.2)基因。结果表明,该基因全长1 294 bp,CDS长1 011 bp,编码336个氨基酸,蛋白相对分子量为36 682.78 kD,理论等电点为5.63,属于疏水性跨膜蛋白,具有典型的ZIP保守结构域;亚细胞定位结果显示该蛋白定位于细胞膜上。同源蛋白比对分析表明,StZnT2基因编码的蛋白质与潘那利番茄(S. pennellii)、番茄(S. lycopersicum)和科民茄(S. commersonii)相似度最高。马铃薯在缺乏锌和过量锌培养条件下均表现出植株矮小、根系伸长受到抑制。实时荧光定量PCR分析不同锌浓度胁迫下基因的表达模式,结果表明,StZnT2在缺锌和过量锌胁迫下表达量均上调,且在根中表达水平最高。本研究结果为进一步阐明马铃薯StZnT2基因功能提供理论依据。
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