【摘 要】
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【目的】监测深圳市肠道病毒（EV）的病原谱及主要流行病毒型别，为人肠道病毒病的防治提供科学依据。【方法】利用荧光定量PCR技术对2016-2022年深圳市大鹏新区采集的疑似手足口病、疱疹性咽峡炎及发热门诊标本进行EV检测；利用巢式反转录PCR扩增EV阳性标本的VP1片段，对扩增产物进行测序，构建基于VP1基因的进化树，并进行基因分型。【结果】共检测疑似手足口标本1 124份，阳性740份（65.8
【基金项目】
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深圳市大鹏新区科技创新和产业发展专项资金资助项目（YL202001-02）； 深圳市科技计划资助（JCYJ20210324133014039）；
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【目的】监测深圳市肠道病毒（EV）的病原谱及主要流行病毒型别，为人肠道病毒病的防治提供科学依据。【方法】利用荧光定量PCR技术对2016-2022年深圳市大鹏新区采集的疑似手足口病、疱疹性咽峡炎及发热门诊标本进行EV检测；利用巢式反转录PCR扩增EV阳性标本的VP1片段，对扩增产物进行测序，构建基于VP1基因的进化树，并进行基因分型。【结果】共检测疑似手足口标本1 124份，阳性740份（65.84%），以柯萨奇病毒A6型（CVA6）和柯萨奇病毒A16型（CVA16）为主，呈周期循环趋势。疑似疱疹性咽峡炎标本137份，阳性88份（64.23%），柯萨奇病毒A4型（CVA4）和CVA16为优势毒株；呼吸道感染标本428份，阳性71份（16.59%），在已分型的22株标本中，主要型别为CVA4。深圳流行的优势毒株CVA6与国内大陆地区流行毒株亲缘关系较近，与国外毒株亲缘关系较远。【结论】引起手足口病的肠道病毒流行毒株CVA6和CVA16呈周期性变化趋势，以国内流行传播为主，输入性风险较低，要持续关注其基因变异及毒力变化情况；CVA4是引起呼吸道感染和疱疹性咽峡炎的优势毒株，应进一步加强监测。
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