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目的研究医药行业专利产出与工业产值的动态关系。方法利用协整理论对1994～2009年我国医药专利产出与产值之间的关系进行协整分析与格兰杰因果关系检验,建立了两者之间的误差修正模型。结果我国1994～2009年的医药行业专利产出和工业产值之间存在长期均衡关系,且两者呈双向格兰杰因果关系。结论我国医药行业应努力提升专利申请的质量及转化效率。