冠状病毒所致心力衰竭的组学机制分析及药物预测

来源 :中华心血管病杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ghostlei
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:探讨冠状病毒感染所致心力衰竭(心衰)的机制,并预测对其可能有效的药物。方法:在基因表达数据库(GEO)检索冠状病毒和心衰,并筛选符合实验要求的组学数据。采用R语言Limma程序包进行差异表达基因分析,筛选差异表达基因。将两组差异基因导入R语言clusterProfiler包进行基因本体学(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,取两组结果的交集。采用STRING数据库对所有差异表达基因构建蛋白质互作网络并筛选核心基因。最后采用团队自主研发的表观精准治疗预测平台EpiMed预测冠状病毒所致心衰的治疗药物。结果:在GEO数据库检索并筛选得到GSE59185冠状病毒数据集,根据不同的亚型分为wt组、?E组、?3组、?5组、对照组5组样本,差异分析发现各亚组交集上调基因191?个,下调基因18?个。在GEO数据库检索并筛选得到GSE126062心衰数据集,共筛选差异表达基因495?个,其中上调165?个,下调330?个。冠状病毒与心衰差异表达基因富集分析,取交集处理共有GO条目20条,主要富集在病毒反应、病毒防御反应、Ⅰ型干扰素反应、γ干扰素调节、先天免疫反应调节、病毒生命周期负调控、病毒基因组复制调控等;共有5条KEGG通路,主要与肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、白细胞介素(IL)-17信号通路、细胞因子与受体相互作用、Toll样受体信号通路、人类巨细胞病毒感染有关。蛋白互作网络分析筛选出信号传导及转录激活蛋白3、IL-10、IL-17、TNF、干扰素调节因子9、2′, 5′-寡腺苷酸合成酶1、丝裂原活化蛋白激酶3、S-腺苷甲硫氨酸基区域蛋白2、CXC趋化因子配体10、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3共10?个核心基因。EpiMed平台预测可能对冠状病毒所致心衰有效的药物为TNF-α抑制剂、白藜醇、利托那韦、白芍、维甲酸、连翘、鱼腥草等。结论:多个炎症通路的异常活化可能是冠状病毒感染所致心衰的原因,白藜芦醇、利托那韦、维甲酸、白芍、连翘、鱼腥草可能对其具有治疗作用。
其他文献
何以消烦暑,端坐一院中。  眼前无长物,窗下有清風。  散热由心静,凉生为室空。  此时身自保,难更与人同。
期刊
Huayouza 6, a new semi-winter Brassica napus variety with high-yield, good quality, prematurity and extensive adaptability,was derived from the cross between th
有这样的祖孙三人,他们开启了一场全球艺术之旅.在他们的对话中,艺术的知识与艺术史的脉络逐渐清晰起来,大师身世、名作赏析在祖孙三人的谈论间一一展开.本期让我们跟着他们
期刊
威尔逊先生决定做个小试验,看看儿子长大后会成为什么样的人.他在桌上放了三样东西:一张十元的钞票--代表银行家;一本崭新的圣经--代表教士;还有一瓶威士忌--代表二流子.然后
周末,天气异常炎热,等我做完作业,已是汗流浃背。我刚打开冰箱要拿冰棍吃,就被爸爸拦住了。“有何贵干?”我有气无力地问爸爸。“我们来做个游戏,如果你能回答出我的问题,就
期刊
这一次,我要邀请大家跟我一起做一个科学实验,看看铁钉在什么环境下会生锈。准备的材料有这些:几个透明的有盖的塑料杯子、几根普通的铁钉、几包干燥剂、一杯自来水和一个西
期刊
七月盛夏,我们迎来了中国共产党成立99周年.99年风雨历程,中国共产党领导中国人民砥砺奋进,战胜了一个个艰难险阻,创造了一个个奇迹,谱写了一部壮丽的史诗,迎来了中华民族从
期刊
【摘 要】随着经济全球化浪潮席卷世界,各种思潮与文化意识对中国社会的冲击与渗透,带来了学校教育的变化,也使大学生思想政治教育工作面对新的挑战。本文阐述了新时期大学生思想政治教育工作的新情况与新问题,并从方法与途径创新的角度就进一步加强大学生思想政治教育工作针对性与时效性提出了自己的观点。  【关键词】新时期 大学生思想政治教育工作 思考  随着我国改革开放的不断深化,中国社会正在经历着快速而深刻的
中小企业的国际化成长需要有充足的相关资源作保证,如何及时而有效的获取资源,是目前普遍处于国际化初级阶段的我国中小企业所面临的问题。本文通过对国内外研究的总结,构建
学位
期刊