【摘 要】
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【目的】在全基因组水平上鉴定亚洲棉(Gossypium arboretum L.)AGO蛋白家族成员,分析其进化关系,为亚洲棉遗传改良提供基因资源。【方法】用AGO蛋白保守域在亚洲棉基因组数据库
【机 构】
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西南大学园艺园杯学院/南方山地园艺学教育部重点实验室,中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室/农业部棉花生物学与遗传育种重点实验室
【基金项目】
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国家高科技研究发展计划(863计划)项目(2012AA101108), 中国农业科学院农业科技创新工程项目, 河南省基础与前沿技术研究计划项目(142300413202)
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【目的】在全基因组水平上鉴定亚洲棉(Gossypium arboretum L.)AGO蛋白家族成员,分析其进化关系,为亚洲棉遗传改良提供基因资源。【方法】用AGO蛋白保守域在亚洲棉基因组数据库中进行同源比对,并对AGO蛋白家族的进化关系、基因结构、结构域、染色体定位、三级结构及表达模式等进行生物信息学分析。【结果】从亚洲棉蛋白数据库中共鉴定出11个AGO蛋白家族成员,其编码区长度为2 949~9 807bp,定位在6条染色体上,其中第9号染色体上分布有4个基因;11个AGO家族成员分为5个亚族,亚族内各
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