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丘脑枕核参与多条加工情绪信息的神经通路因而在情绪信息加工中具有重要作用。第一:丘脑枕核参与到上丘?丘脑枕核?杏仁核通路。该通路可以在没有初级视觉皮层参与情况下对情绪信息进行快速加工;第二:丘脑枕核以皮层?丘脑枕核?皮层环路和上丘?丘脑枕核?皮层通路两种形式参与到丘脑枕核?皮层通路。该通路通过控制皮层间同步化水平促进信息传递的效率;同时通过整合皮层和皮层下情绪信号扩大其在行为输出方面的影响力。