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甲型流感血凝素的16种已知的血清型中,3种与过去的大流行有关(H1,H2,H3)。传统的流行病监测集中在监控抗原转变。然而,2009H1N1人畜共患事件表明,即使是在过去的人类流行病中早已遇到的血清型也有可能构成新的威胁。2009人畜共患H1与人类季节性流感H1的蛋白序列差异为20—24%。已知H1与其最接近的血清型H2的差异为40—46%,2009H1大致可视为向一种新血清型发展的中间状态。该情况是一种伪抗原转变。