黄志镗1928年5月20日生于上海，4岁时被送回母亲老家浙江黄岩县城，跟随外祖父母生活。年幼的他从此把黄岩作为自己的故乡，而非祖籍温州永嘉。
　　1939年黄志镗读完小学，正值日军侵略活动加剧，县城地处偏远，交通不便，虽没有遭日军攻占，但已经历了数次轰炸。在这种情况下，县立中学初中部4个班于1938年9月迁至黄岩西乡灵石书院。灵石得名于东晋年间从天而降的一块陨石。灵石书院藏于群山深处，可以有效地躲避空袭。最显眼的是大雄宝殿前的一座灵石寺塔。休学半年的黄志镗于1940年升入初中，进入县立中学初中部春季一年级读书，1944年进入高中部春季一年级。
　　上海沦陷后，一些高校的教师流亡到黄岩，充实了黄岩中学的教师队伍。其中一位是曾任中央研究院化学研究所助理研究员、交通大学讲师的袁积诚先生，他担任了初高中化学和高中矿物课教师。袁积诚有丰富的教学经验，化学功底十分深厚，对教材更是倒背如流，尤其能够从学生感兴趣的事情入手，教会学生很多实验。有袁积诚这样的老师来任教，那几届黄岩中学的学生是非常幸运的。黄志镗说：“袁积诚先生对我影响最大，可以说是独一无二的影响。”高中二年级开设化学课，就是从那时起，黄志镗对化学产生了强烈的兴趣，甚至已“醉身于化学之中”。当时他非但阅读了可以到手的有关化学的书籍，而且在那样困难的条件下，还尽量做些实验，以电灯泡来代替烧瓶，到南货铺中搜罗药品。黄志镗认为：“如果说我对化学的研究有成就的话，应该说是那时袁先生给我打下了坚实的基础。”
　　抗战结束，这批名师返回上海，读完高二的黄志镗也到上海投奔母亲。母亲托人替他在上海的银行找到一份练习生的差事，这在当时是相当不错的工作。可是已经痴迷化学的他不顾母亲的反对，通过一位同乡的关系，到化学试剂厂当了学徒。后来一名同学给他弄到一张高中毕业证书，黄志镗即准备直接投考同济大学。填报志愿时，他毫不犹豫地选择化学系，并最终被录取。