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利用PCR-RFLP方法对捕食线虫真菌隔指孢属进行了系统发育研究。以ITS1和ITS4为引物对该属8种8个菌株的核糖体DNA转录间区(ITS)进行了PCR扩增,4种内切酶(AluⅠ,HaeⅢ,HpaⅡ,TaqⅠ)酶切。结果表明,该属的ITS区长度没有明显差异,其分子长在564-595bp之间,酶切图谱能体现不同种间的多态性,根据4种内切酶酶切结果,利用UPGMA法构建的节丛孢属分子系统树,基本体现了属内不同种间的亲缘关系,从分子水平证明了隔指孢属形态分类上的合理性。