【摘 要】
：
[目的]分析杓兰叶绿体基因组密码子的使用偏好性,探究影响杓兰叶绿体基因组密码子使用偏好性的主要因素,为兰科叶绿体基因组学研究提供参考。[方法]从NCBI数据库中下载完整的杓兰叶绿体基因组序列并进行蛋白编码序列筛选,利用EMBOSS在线程序计算各基因及密码子的GC含量,利用CodonW软件计算各基因的氨基酸长度(Laa)、有效密码子数(ENC)、同义密码子相对使用度(RSCU)、最优密码子使用频率(FOP)及各基因密码子的第3核苷酸碱基含量,利用SPSS软件分析各指标之间的相关性,利用Origin软件绘图。
【机 构】
：
沈阳农业大学土地与环境学院,沈阳农业大学生物科学技术学院,沈阳农业大学林学院
【基金项目】
：
国家自然科学基金(31670378),辽宁省“兴辽英才计划”项目(XLYC1807180),沈阳农业大学大学生创新创业训练计划项目(2020-109)。
论文部分内容阅读
[目的]分析杓兰叶绿体基因组密码子的使用偏好性,探究影响杓兰叶绿体基因组密码子使用偏好性的主要因素,为兰科叶绿体基因组学研究提供参考。[方法]从NCBI数据库中下载完整的杓兰叶绿体基因组序列并进行蛋白编码序列筛选,利用EMBOSS在线程序计算各基因及密码子的GC含量,利用CodonW软件计算各基因的氨基酸长度(Laa)、有效密码子数(ENC)、同义密码子相对使用度(RSCU)、最优密码子使用频率(FOP)及各基因密码子的第3核苷酸碱基含量,利用SPSS软件分析各指标之间的相关性,利用Origin软件绘图。
其他文献
[目的]感觉神经元膜蛋白(SNMP)是至关重要的次要嗅觉蛋白,能够作为信息素识别的标记,而红脊长蝽(Tropidothorax elegans)作为一个重要的农林害虫,这方面的研究还很少。[方法]利用PCR方法对红脊长蝽SNMP基因进行克隆,并通过荧光定量PCR对该基因的表达情况进行分析。[结果]首次克隆和鉴定了红脊长蝽的2个SNMPs基因,并命名为TeleSNMP1和TeleSNMP2。序列分析表明,TeleSNMP1编码区开放阅读框长1497 bp,编码498 aa;而TeleSNMP2编码区开放阅读
[目的]挖掘和鉴定桉树中响应种植密度的木质部生成关键基因,阐释种植密度影响林木径向生长的分子机制。[方法]通过PacBio Iso-Seq和RNA-Seq联合分析,鉴定了在高、低2个种植密度水平下尾巨桉DH32-29主茎的差异表达转录本并利用qRT-PCR进行组织表达分析。[结果]分别获得45490条在主茎中表达的非冗余全长转录本和443条在木质部中差异表达的转录本,并鉴定出60条差异表达的调控因子编码基因。在低种植密度条件下,植株直径生长量显著增加;参与细胞分裂调控的PXL2及其互作基因CUL1和T15
[目的]平潭岛原生滨海植物群落种间关系分析有助于深入了解滨海植物群落结构特征和共存机制,对海岛滨海植被的管理恢复与保护有重要的意义。[方法]本研究在群落调查的基础上,通过方差比率法(VR),χ2检验,Spearman秩相关系数检验及典范对应分析(CCA排序),对平潭岛滨海4种典型生境类型(基岩灌丛、低山丘陵灌丛、砂生草甸、基岩草丛)的植物群落优势种(重要值≥1)进行了种间联结、相关性分析,并进行生态种组划分。[结果]4种生境类型的滨海植物群落总体间均呈显著正关联(VR>1,W&
[目的]杏树鬃球蚧在新疆野果林暴发成灾,对野杏生存和野果林生态环境造成重大危害。本研究揭示该虫在新疆野杏上的生物学特性,旨在为防控杏树鬃球蚧提供科学依据。[方法]2019年6月至2020年6月,在新疆巩留县和新源县通过室内实验和野外调查相结合,研究了杏树鬃球蚧的形态特征、生活史、习性。[结果]杏树鬃球蚧属于性二型昆虫,雌成虫呈半球形,雄虫有翅。在新疆野果林1年发生1代,主要以2龄若虫在枝条上越冬,越冬死亡率在65%以上,雌雄性比为1.02∶1。雌成虫平均产卵量527粒,卵的发育起点温度9.50℃,有效积温
“互联网+”背景下,发展电子商务已成为拓展特色农产品市场的重要方式。从农户资源禀赋、区域环境条件两方面选取变量,实证分析农户参与农产品电子商务意愿及主要影响因素。结果显示,现阶段农户实际参与度不高,但参与意愿强烈。影响农户参与电子商务的主要因素包括农户对农村电子商务的认知程度偏低、农业生产规模受限、相关电子商务配套设施不完善、政府支持力度不够等。
结合学者王天兰、王天津撰写,由中央民族大学出版社于2019年12月出版的《新时代农村经济体制的再改革——青岛西海岸新区改革试点举例》(以下简称《再改革》)一书,总结了山东近年来土地流转的成功经验并提出若干深化改革的建议。
通过动态聚类分析的方法,分析了甘肃省14个市(州)1995年、2005年、2015年、2018年的农业综合实力动态变化。同时,利用贝叶斯准则多类逐步判别分析方法对聚类结果进行判别分类,在4次计算分析中,两种不同的计算结果完全一致。通过相关分析,根据农业综合实力,将14个市(州)分为强、较强、较弱、弱4类。其中,武威市、张掖市属于农业综合实力强类,白银市、天水市、平凉市、庆阳市、定西市、陇南市属于较强类,兰州市、酒泉市、临夏回族自治州属于较弱类,嘉峪关市、金昌市、甘南藏族自治州属于弱类。
[目的]开展降香黄檀扦插繁殖试验,探究不同浓度IAA和NAA对降香黄檀根系和新梢发育的影响,为降香黄檀优良单株材料的快速繁育和栽培提供理论和技术支撑。[方法]以2年生降香黄檀实生苗为采穗母株,依据IAA浓度、NAA浓度及浸泡时间设计正交试验;调查扦插80 d后不同处理间的生根率、根系发育和新梢发育指标,并运用隶属函数值法和主成分分析法对其繁殖效果进行综合评价。[结果]IAA浓度、NAA浓度、浸泡时间、IAA浓度与NAA浓度的交互效应以及IAA浓度与浸泡时间的交互效应对生根率的影响均差异极显著(P<0
采用海关数据库与工业企业数据库数据,在回顾现有文献的基础上采用二元Logit模型,研究了引入外资规模与农副产品加工企业出口意愿之间的关系。结果显示,外资规模的扩大会显著提升农副产品加工企业出口的意愿,在东部企业中的表现尤为明显。根据研究结论提出了鼓励跨境资本流入与合理配置外资流动方向等政策建议。
农业农村现代化是乡村振兴战略的重要内容。研究河南省农业现代化发展水平,有助于河南省实现由农业大省转向农业强省和乡村振兴战略的目标。根据农业现代化评价指标体系,利用熵值法对河南省2009—2018年农业现代化发展水平进行综合评估,探讨了河南省农业现代化发展趋势。结果表明,截至2018年河南省农业现代化综合评价值为0.8149,按照目前普遍采用的农业现代化阶段划分标准,结合河南省实际情况,当前河南省已初步实现农业现代化。