深圳市H5N6、H7N9流感病毒NA?UTR序列特征

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目的 分析深圳市H5N6、H7N9流感病毒神经氨酸酶(NA)基因非翻译区(UTR)的分子特性,为进一步探究NA基因与流感病毒转录复制及包装之间的关系奠定理论基础.方法 使用MEGA 7.0、DNAstar7.1.0等生物信息分析软件对全球和深圳H5N6、H7N9流感病毒NA的UTR进行核苷酸序列同源性分析及基因多态性分析.结果 2014-2015年深圳市H5N6病毒与其他HXN6病毒株比较,NA?3′端核苷酸同源性为95.1%~100.0%,H5N6?NA 3′?UTR高度保守;5′端UTR核苷酸同源性为89.7%~100.0%,H5N6?NA 5′?UTR主要在第23、27、29及33位发生突变.8株2013-2014年深圳市H7N9病毒与其他HXN9流感病毒株比较,NA?5′端UTR核苷酸同源性为93.3%~100.0%,其在第4、6及23位发生突变.结论 深圳市人感染H5N6及H7N9病毒NA?UTR的保守区具有高度同源性,其可变区具有基因多态性.
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