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闽江源自然保护区具有维管束植物1078种(包括亚、变种),隶属于168科,635属.该区具有种类较为丰富,起源古老,孑遗植物较多,地理联系广泛等特点.在植物区系地理成分中,热带性质的成分占主导地位,主要为泛热带分布、热带亚洲分布、旧世界热带分布等.北温带分布及东亚分布等温带区系成分亦较为丰富.还论述了闽江源与邻近地区植物区系的关系.