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采用海绵组织离散、细胞分离的方法，对繁茂膜海绵细胞进行纯化、胞内微生物DNA提取，构建了繁茂膜海绵细胞内微生物的16S rDNA克隆，对其遗传多样性进行了分析，发现海绵细胞内微生物16S rDNA序列主要归类于紫硫细菌门（Proteobacteria）中的α-亚门、γ-亚门和浮霉菌门（Planctomycetes）等类群。与研磨直接提取海绵组织DNA所得海绵组织中总微生物多样性相比，海绵细胞内存在丰富的浮霉菌（23％），说明浮霉菌主要存在于海绵细胞胞内。