虎眼万年青EST文库构建和Syntaxin基因的克隆及生物信息学分析

来源 :中国医药生物技术 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dragonfly
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目的构建虎眼万年青 EST 文库,筛选相关基因并对其进行功能鉴定。方法 CTAB 法提取虎眼万年青鳞茎总 RNA,通过SMART 方法构建全长 cDNA 文库,获得库容大于3×106 cfu/ml 的均一化全长 cDNA 文库。随机挑取1440个单克隆测序,并对得到的 EST 序列进行 Blast 分析(NR、NT、Swiss-Prot 和 KEGG)以及 COG 功能分类。结果获得1398条有效 EST 序列,含有1146条单一基因,cDNA 文库平均插入片段长度在1.5 kb 以上,全长率5
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