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庙岛群岛有种子植物81科288属504种，发现2新变种，2属、19种为山东省新记录。以属的分析为主，结合种的分析，认为该地区种子植物区系为温带性质。该地区温带分布型属占总属数的56．6％，热带分布型属占总属数的33．2％，缺乏典型的热带科属。庙岛群岛南北植物交汇，具有复杂区系成分，优势现象明显，且拥有较多的滨海植物。该地区特有现象不明显，共有中国特有属3个，无地区特有属。庙岛群岛种子植物区系与邻近地区研究表明，在属级水平上，庙岛群岛种子植物区系与河北、辽宁的相似性较高，与安徽、江苏和北京的相似性依次递减。