原发性皮肤恶性黑色素瘤相关miRNA筛选及其靶基因的生物信息学分析

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【摘要】

：

目的筛选原发性皮肤恶性黑色素瘤的相关miRNA及其靶基因,并进行生物信息学分析。方法在GEO数据库中选择GPL15019、GPL15183芯片数据,通过GEO2R在线分析工具筛选出皮肤恶性黑

【作者】

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李慧王柯

【机构】

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河南省人民医院河南大学临床医学院,郑州大学人民医院,郑州大学附属洛阳市中心医院

【出处】

：

山东医药

【发表日期】

：

2019年20期

【关键词】

：

皮肤肿瘤恶性黑色素瘤微小RNA 生物信息学

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目的筛选原发性皮肤恶性黑色素瘤的相关miRNA及其靶基因,并进行生物信息学分析。方法在GEO数据库中选择GPL15019、GPL15183芯片数据,通过GEO2R在线分析工具筛选出皮肤恶性黑色素瘤中差异表达的miRNA,两组芯片取交集后获得共同差异表达miRNA,借助miRecords平台预测miRNA靶基因。通过DAVID工具进行基因功能(GO)分析和KEGG通路富集分析预测靶基因功能和相关通路。利用STRING平台及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并筛选出核心基因。在比较

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