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如何构造软件Agent，一直是研究界和工程界所关心的问题。目前工程上采用的软组件方法，虽然在解决软件Agent的构造复杂度方面做出了积极的贡献，但尚没有给出软件Agent从概念级设计到实现级设计的控制线索。文章采用生物组织学概念。提出了软件细胞、软件基因和软件碱基对的概念，并基于细胞、基因和碱基对之间的嵌套构造关系，给出了一类称之为模拟生物模型的软件Agent构造方法。该方法突出了软件Agent从概念设计到实现设计的层次性和过程性。不仅使得软件Agent构造线索清晰，而且易于做到构造过程的优化控制。