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卫生费用分配总额测算是卫生总费用核算体系的第二个层次，是按照卫生服务机构分类对卫生总费用进行测算。从卫生职能机构划分，卫生费用表现为不同级别的医疗机构费用、公共卫生机构费用、药品零售机构费用、卫生行政管理机构费用及医学科研机构费用等，反映卫生资金在各级各类卫生机构的分配使用情况，可用来分析与评价卫生资源配置的效率与公平。