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生物肥料产业近十年得到了持续快速稳定发展，尤其是近几年以每年10％以上的速度发展。据农业部微生物肥料和食用菌菌种质检中心主任李俊介绍，目前有关生物肥料企业总数有1100个以上，年产量1200万吨，年产总值达200亿元。截至2016年5月，农业部登记证产品有2742个，其中正式证1488个，临时证1254个。