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采用RT-PCR方法对5份疑似流行性腹泻病毒感染猪场采集的腹泻粪便样品和小肠组织样品进行扩增、克隆和测序,并利用DNAStar进行序列对比及进化分析。结果表明:5个PEDVS及ORF3基因核苷酸序列同源性为96.2%~99.6%,氨基酸同源性为86.3%~99.3%。与经典病毒株CV777相比,CH—GZH毒株在PEDVS基因3581~3583bp处存在3个核苷酸缺失;CH-ZJ毒株在ORF3基因245~293bp处缺失49个核苷酸。S及ORF3基因进化树分析结果表明,4株PEDV与中国毒株BJ.2011