一种同时分析瘤胃细菌、古菌和真核微生物的测序方法

来源 :中国畜牧兽医 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hxr906646527
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反刍动物利用复杂的瘤胃微生物群落将日粮纤维转化为能量物质,因此本试验建立了一种可同时分析细菌、古菌16SrRNA基因及原虫18SrRNA基因、真菌核糖体间隔区1基因的方法。通过测定3种反刍动物(绵羊、欧洲牛、鹿)11个瘤胃样品中的12个DNA样品,结合454测序,结果发现,乳化PCR前组间DNA模板的混合比例有助于增加扩增子长度的一致性。与非特异性通用引物相反,这一方法可避免对非目标DNA测序,如植物或其内生菌rRNA基因,分辨率较高。通过不同的引物进一步分析发现,样品来源较引物对群落的影响更大,但是引物
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