长穗偃麦草EeSKOR基因片段的克隆、表达及其生物信息学分析

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhh6622692
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外整流钾离子转运蛋白(SKOR)在植物细胞抵御盐胁迫、保持胞内钾稳态过程中发挥重要作用.本研究采用RT-PCR结合RACE技术提取长穗偃麦草RNA,设计引物对长穗偃麦草EeSKOR基因的生物信息学及其表达模式进行了分析.结果 表明,EeSKOR核心片段为555 bp,核心氨基酸与小麦SKOR核心氨基酸同源性高达90%以上.EeSKOR片段全长cDNA为2 402 bp,编码717个氨基酸,包含2 154 bp的开放阅读框(ORF),78 bp的5'非编码区(UTR)和170bp的3'非编码区(UTR).所得序列与其他植物氨基酸序列同源性均在80%以上,与小麦TaSKOR氨基酸同源性高达87.67%.EeSKOR含有SKOR类蛋白的P环结构,具丝氨酸位点,并随NaCl处理浓度的增加,与对照相比,长穗偃麦草植株叶鞘和叶片中EeSKOR基因表达水平呈下降趋势,总体表现为根>叶片>叶鞘的变化趋势,说明长穗偃麦草EeSKOR基因的表达受到盐胁迫诱导和调节.
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