【摘 要】
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基于\'芙蓉李\'(Prunus salicina)基因组数据,采用生物信息学分析方法鉴定糖转运蛋白家族基因,并对其蛋白质理化特性、亚细胞定位、系统进化树、蛋白质保守结构域以及表达模式进行分析.共鉴定出49个该家族基因,根据保守结构域和系统发育分析将其分为7个亚家族.蛋白质介于313～948个氨基酸之间,预测定位于质膜或液泡膜;所有的蛋白都含有保守的糖转运体结构域(PF00083),其中大多数含有12个跨膜螺旋.通过比对\'芙蓉李\'果实发育过程的RNA-seq数据,对49个基因进行表达谱
【机 构】
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福建省农业科学院果树研究所,福建省落叶果树工程技术研究中心,福州350013
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基于\'芙蓉李\'(Prunus salicina)基因组数据,采用生物信息学分析方法鉴定糖转运蛋白家族基因,并对其蛋白质理化特性、亚细胞定位、系统进化树、蛋白质保守结构域以及表达模式进行分析.共鉴定出49个该家族基因,根据保守结构域和系统发育分析将其分为7个亚家族.蛋白质介于313～948个氨基酸之间,预测定位于质膜或液泡膜;所有的蛋白都含有保守的糖转运体结构域(PF00083),其中大多数含有12个跨膜螺旋.通过比对\'芙蓉李\'果实发育过程的RNA-seq数据,对49个基因进行表达谱分析,其中15个在果实不同发育阶段差异表达;qRT-PCR分析表明,15个差异表达基因中有9个基因与果实葡萄糖和蔗糖含量显著正/负相关,其中1个肌醇转运蛋白亚家族基因(PsINT4)、1个糖转运蛋白亚家族基因(PsSTP11)、1个糖促进蛋白亚家族基因(PsSFP5)和1个液泡单糖转运蛋白亚家族基因(PsTMT1)在\'芙蓉李\'果实发育过程中具有较高的表达量,可能在\'芙蓉李\'果实发育和成熟过程中对糖分积累起重要作用.
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