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目的：探讨红树植物秋茄简单序列重复区间扩增多态性分子标记（ISSR—PCR）分析的最优条件，以获得清晰、重复性好的简单序列重复区间扩增多态性（ISSR）扩增结果。方法：对ISSR—PCR多个条件中的单个条件包括DNA的提取、模板浓度、Taq酶的选择与用量、Mg^2＋和三磷酸脱氧核糖核苷酸（dNTP）浓度等进行了比较、优化。结果：从单条件中得出每个条件的最优条件，从而获得清晰、重复性高的电泳图谱。结论：秋茄ISSR—PCR分析最适宜的扩增条件为：25μL PCR反应体积中，0．75～1．0UTaqDNA聚合