【摘 要】
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计算机方法识别转录因子结合位点（TFBS，也称“模式”）是目前生物信息学的一个很有吸引性和挑战性的课题。吉布斯采样识别模式的算法本质上是一个启发式搜索方法，容易陷入非全局最
【机 构】
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中山大学电子与通信工程系,华南肿瘤学国家重点实验室中山大学肿瘤防治中心
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(60474075)
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计算机方法识别转录因子结合位点（TFBS，也称“模式”）是目前生物信息学的一个很有吸引性和挑战性的课题。吉布斯采样识别模式的算法本质上是一个启发式搜索方法，容易陷入非全局最优的局部最大值。为此，提出了一种改进的吉布斯采样策略YGMS（Yeast Gibbs Motif Sampler）采识别酿酒酵母共表达基因调控区域转录因子结合位点。在酵母的共调控基因序列的数据集测试中，YGMS比其他几个基于吉布斯采样算法更有效地识别出真实模式序列，在一定程度上提高了算法的性能。
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