目的　建立风疹病毒包膜糖蛋白E1的克隆载体 ;研究E1基因变异情况 ,并对其序列进行系统发生树分析。方法　利用RT PCR方法扩增并回收风疹病毒JR2 3株的包膜糖蛋白E1的基因片段 ,将其与PMD 18T载体连接 ,经氨苄青霉素筛选 ,酶切鉴定 ,以获得风疹病毒E1蛋白基因的克隆。将此基因测序后 ,利用DNASTAR和WINSTAR软件包绘制系统发生树进行序列之间的比较分析。结果　筛选出含有风疹病毒E1蛋白基因的克隆。序列分析及发生树的绘制表明 :JR2 3株与日本TCRB株及英国THOMAS株差别最小 ,分别为 0 .9%和 1.2 %。与北京BRD2株及香港XG379株差别最大 ,分别为 7.6 %和 7.3% ,与其它各株的差别均小于 3% (除NC株为 3.7%外 ) ,系统发生也与THO MAS株、TCRB株最近 ,与BRD2株最远。结论　克隆载体的建立为进一步研究E1基因与糖蛋白功能的关系提供基础。系统发生树表明中国不同地区风疹流行株基因序列存在明显差异。这对风疹病毒遗传与变异、分子流行病学研究 ,以及制备有效的亚单位疫苗提供了资料