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我国财政分权制度对政府卫生支出效率具有重要影响。中央和地方政府在财政收支格局中的不平衡降低了地方政府卫生支出的积极性,并间接导致了医疗机构的过度医疗和以药养医,造成政府卫生支出的浪费;地方政府承担卫生支出的主要责任导致中西部地区的政府卫生支出水平和占比明显低于东部地区,但卫生支出效率高于东部,卫生支出向资源已相对饱和的东部地区不断集中造成了整体支出效率低下;卫生事业的各级政府层层负责制导致卫生资源向上集中,从而造成医疗支出的低效。尤其是＂重城轻乡＂的格局不利于卫生支出流向健康水平更低的农村地区。要扭转这些