菠菜耐寒能力强，能忍受-7℃左右的低温，解冻后仍可恢复新鲜状态。因此，菠菜冻藏就是要求温度降到菠菜冰点以下，细胞中的游离水开始结冻，当外界温度逐渐升高时，细胞的生活功能又开始恢复，即要在不致丧失蔬菜组织细胞生活功能的前提下冻结。同时，在这样的低温下，又可抑制酶的活性和病菌的活动，从而使蔬菜能长期储藏。
　　一、采收
　　一般早秋菠菜播后40～45天开始收获，冬季栽培的播后60～70天才可采收。用于储藏的菠菜要注意控制浇水量，收获前1周停止浇水，减少植株含水量，使植株健壮、不徒长，叶片呈深绿色、厚实。采收宜在晴天进行，雨后过湿不宜采收。
　　二、质量检测要求（外观）
　　菠菜应鲜嫩、翠绿，叶片光洁，无泥土及草，无白斑，无病虫害，无老叶、黄叶、子叶。切根后，根长不超过0.5厘米，净菜茎叶5～7根，茎叶全长14～20厘米。
　　三、本地鲜销
　　菠菜从菜地采收后，在清水池中轻轻淋洗，去掉污泥，在室内整理一遍，按质量检测要求分成等级，扎成0.5～1千克小捆，然后整齐地装入菜筐，运至销售点，保持鲜嫩销售。
　　四、采后预处理
　　用于采后储藏的菠菜要进行预处理，收获后摘去黄枯烂叶，留部分短根，并处理干净，整理捆把，约0.5千克1把，装筐，放置阴凉处预储降温，或用冷藏设备预冷。
　　五、包装与储藏
　　菠菜储藏的适宜温度为0～2℃，相对湿度为90%～95%，氧气含量为11%～12%，二氧化碳含量为5%～6%，故宜采用塑料薄膜包装或人工气调储藏。将待储菠菜进行挑选、整理，剔除病株和单片叶后打捆（每捆以0.5千克为宜），然后装入筐内，每筐约装10千克，在0～1℃条件下预冷1天。预冷后的菠菜用0.04～0.06毫米厚的聚乙烯薄膜制成100厘米×75厘米规格的袋子包装，每袋装7.5千克，装袋时，将菠菜根朝袋的两端，叶对叶码3层，每层8捆，装袋后，松扎袋口，分层摆放在冷库的菜架上。为保护袋内气体成分稳定，每隔7～10天测1次二氧化碳含量，可开袋换气1次，并擦去袋内凝结水。用以上储藏方法，菠菜可储1～2个月。也可用塑料筐或箱直接包装、堆码，码垛用塑料薄膜大帐覆盖封闭储藏。
　　六、保鲜包装方式
　　菠菜的保鲜包装方式，主要是袋装和箱装两种。无论是袋装还是箱装，都要先把菠菜打成捆，每捆重量200～300克，打捆有利于箱内或袋中热量的散发和气体的流动。
　　1. 袋装
　　袋装方式多以聚乙烯塑料薄膜袋为多，也有用聚丙烯薄膜袋包装的。一般所用塑料袋装不宜过于密封，要求有一定的透气性，故对阻隔性过强的塑料包装应设置专门的透气孔。而且每袋的重量不宜太重，通常以10～15千克为宜。
　　2. 纸箱
　　纸箱包装菠菜，一般用3～5层瓦楞纸箱，纸箱有专门的规格。每个纸箱的规格，按规定的重量加以限制，各个地区、各个国家的做法不完全相同。日本纸箱包装菠菜的规格为每一箱装30～40捆。菠菜的纸箱包装分横装和竖装两种。日本的横装纸箱尺寸规格为470毫米（长）×365毫米（宽）×175毫米（高）；竖装纸箱尺寸规格为610毫米（长）×350毫米（宽）×300毫米（高）。菠菜易于腐烂，在0℃和空气相对湿度为95%～100%的条件下，保鲜期只有10～14天，一般应控制在0℃左右，并用带透气孔的聚乙烯膜包装出售。