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消毒是指消除或杀灭由传染源排到外界环境中的病原体。它是动物防疫三大技术措施之一，与免疫、扑疫并重，也是切断传播途径、防止传染病的发生和蔓延的一项重要举措。消毒工作说起来容易，做起来却很困难。在农村由于传统的重免疫治疗轻消毒意识影响，消毒机制模糊及消毒剂选择不当，往往造成疫病防控失效，造成重大的经济损失，只有制定和采取一整套严密的消毒措施，才能有效地消灭散播于环境、鸡体表面及工具上的病原体，切断传染途径，从而促使鸡的健康成长，对于养鸡户来说，掌握正确的消毒方法、消毒措施及注意事项，搞好消毒工作，可大大降低鸡群的发病率，减少经济损失。现将消毒方法总结如下，希望和广大的养殖户共同探讨。
一、有机物必须彻底清除
鸡粪等有机物残留于鸡舍地面，病毒、细菌和球虫卵囊会藏在其中，同时有机物的存在会降低消毒剂作用效果，致使消毒无效。因此，消毒前必须实施彻底的洗涤清洁，才能达到消毒的目的，消毒按天棚——墙壁——饲槽——地面的顺序进行，年久污垢要人工彻底刷洗干净。
二、只用一种消毒剂达不到彻底消毒的目的
鸡的病原体种类很多，只用一种消毒剂无法把所有病原体消灭干净，要彻底消毒鸡舍，最少要准备并使用三种以上的消毒剂。选择鸡舍用消毒剂须注意以下几点：（1）消毒效力强，对各种病原体都有效的光谱消毒剂；（2）效力快且作用时间长的消毒剂；（3）效力安定，不易受有机物、盐类、酸及碱的作用而失败；（4）渗透力强，可以渗透到有机物、排泄物内；（5）毒性、刺激性、腐蚀性小。
三、清洗、消毒、充分凉干
清洗后要等干燥后才可第一次消毒，再等充分干燥后进行第二次及第三次消毒，因为清洗后即行第一次消毒或第一次消毒后地面未干就进行第二次消毒，散布或喷雾的消毒液会被残留于地面的水或消毒液稀释（或中和），特别是地面凹处的水；另外，清洗后空舍或消毒后空余的时间越长，消毒效果越好。空舍消毒一般要求使用2-3种不同作用类型的消毒药进行2-3次消毒。只进行1次消毒或只用1种消毒剂，效果是不完全的，因为不同的病原体对不同的消毒剂敏感性不同。第一次消毒可用碱性消毒剂，如1-4％的烧碱或10％的石灰乳，用来粉刷地面、墙壁。适当浓度烧碱溶液还可用于喷雾消毒。第二次消毒可用酚类或氧化剂（过氧乙酸）进行喷雾消毒。第三次用甲醛熏蒸消毒。可用加热法或氧化法熏蒸，使用氧化法时先计算好消毒容积，每立方米用42mL福尔马林、21g高锰酸钾，氧化消毒要关闭门窗，加热至20℃，相对湿度70％以上，作用7-24h。
四、适当的浓度。足够的量
消毒剂须按规定稀释，浓度不能太高或太低。一般而言，鸡舍越脏，所需药液量也越多。消毒鸡舍时所散布的药液量不能省。
五、带鸡喷雾消毒
因为鸡体本身携带、排出、传播病原微生物，加上外界病原微生物难免也会通过人体、饲料的携带和空气的传播等途径随时进入鸡舍，所以有必要带鸡消毒以消除疾病隐患。方法：刚出孵化场的初生雏在进入育雏室之前须进行一次全身性喷雾消毒，育雏期每日喷雾消毒一次，育成期每2日一次，产蛋期每3～5日一次。消毒期间须注意①鸡舍勤打扫，及时清除粪便、污物及灰尘，以免降低消毒质量；②喷雾程度以地面、墙壁、屋顶均匀湿润和鸡体表稍湿为好；③稀释消毒液用的水温要适当，应提前加热到室温；④喷雾造成鸡舍、鸡体表潮湿，消毒后要开窗通气，促其尽快干燥；⑤喷雾时室温比平时温度提高3-4℃，使被喷湿的鸡体得到适宜的温度，以免受冷挤堆压死；⑥各类消毒剂交替使用，每月轮换一次；⑦鸡群接种疫苗前后3天内停止喷雾消毒。
六、饮水消毒：要准确掌握好浓度
选择饮水用消毒剂须注意以下几点：①对病原体有强大杀灭作用；②长期使用无毒副作用；③适口性好；④不会在肉蛋中残留；⑤无致癌、致畸、致突变性。例如选择漂白粉、新洁尔灭、百毒杀等。另外，在进行饮水免疫前后各3天应停止饮水消毒，水槽不能用消毒剂清洗。
七、孵化消毒
1 种蛋消毒
在每天收集种蛋时，要及时剔除被粪便污染的种蛋，然后在舍内的消毒箱中用甲醛一高锰酸钾熏蒸消毒或固体甲醛熏蒸消毒。种蛋装入孵化器后，在开机前再消毒1次。种蛋孵化至第19天进入出雏阶段，由孵化器将种蛋倒入出雏器后，再进行1次消毒。
2 出雏阶段的消毒
当鸡雏破壳出雏达10-15％时，开始用福尔马林熏蒸消毒，在出雏率达到90％左右时熏蒸消毒，使用过氧化物类、氯制剂类等消毒药物喷雾消毒。
3 孵化器、出雏器及孵化用具的消毒
孵化器、出雏器、孵化用具在每次用后要进行彻底清洗、刷拭干净，经严格的消毒后待用。消毒药品可选用氯制剂类。
八、粪便消毒
鸡粪、垃圾应及时清除，并运至远离鸡场的指定地方，采用发酵法或堆粪法进行消毒。
九、工作人员消毒
鸡场工作人员在进入生产区之前，必须更换消毒过的工作服及胶鞋等，并在紫外线灯下消毒10分钟左右后，方可进入鸡场。鸡舍门口设有脚踏消毒槽，其宽度与门宽度一致，水深没过鞋面。门内设洗手盆。
十、对入场的车辆进行消毒
场区门口设置火碱池，对入场的车辆轮胎进行消毒。门口内设消毒水泵，用无腐蚀性的消毒剂对入场车辆的车体进行喷雾消毒。
十一、对外来人员进行消毒
门口设置更衣室，并安装紫外消毒装置。非生产人员及外来人员，未经允许不得进入生产区；必须进入生产区时，要更换消毒过的防护服、鞋、帽，方可进入场区。
一、有机物必须彻底清除
鸡粪等有机物残留于鸡舍地面，病毒、细菌和球虫卵囊会藏在其中，同时有机物的存在会降低消毒剂作用效果，致使消毒无效。因此，消毒前必须实施彻底的洗涤清洁，才能达到消毒的目的，消毒按天棚——墙壁——饲槽——地面的顺序进行，年久污垢要人工彻底刷洗干净。
二、只用一种消毒剂达不到彻底消毒的目的
鸡的病原体种类很多，只用一种消毒剂无法把所有病原体消灭干净，要彻底消毒鸡舍，最少要准备并使用三种以上的消毒剂。选择鸡舍用消毒剂须注意以下几点：（1）消毒效力强，对各种病原体都有效的光谱消毒剂；（2）效力快且作用时间长的消毒剂；（3）效力安定，不易受有机物、盐类、酸及碱的作用而失败；（4）渗透力强，可以渗透到有机物、排泄物内；（5）毒性、刺激性、腐蚀性小。
三、清洗、消毒、充分凉干
清洗后要等干燥后才可第一次消毒，再等充分干燥后进行第二次及第三次消毒，因为清洗后即行第一次消毒或第一次消毒后地面未干就进行第二次消毒，散布或喷雾的消毒液会被残留于地面的水或消毒液稀释（或中和），特别是地面凹处的水；另外，清洗后空舍或消毒后空余的时间越长，消毒效果越好。空舍消毒一般要求使用2-3种不同作用类型的消毒药进行2-3次消毒。只进行1次消毒或只用1种消毒剂，效果是不完全的，因为不同的病原体对不同的消毒剂敏感性不同。第一次消毒可用碱性消毒剂，如1-4％的烧碱或10％的石灰乳，用来粉刷地面、墙壁。适当浓度烧碱溶液还可用于喷雾消毒。第二次消毒可用酚类或氧化剂（过氧乙酸）进行喷雾消毒。第三次用甲醛熏蒸消毒。可用加热法或氧化法熏蒸，使用氧化法时先计算好消毒容积，每立方米用42mL福尔马林、21g高锰酸钾，氧化消毒要关闭门窗，加热至20℃，相对湿度70％以上，作用7-24h。
四、适当的浓度。足够的量
消毒剂须按规定稀释，浓度不能太高或太低。一般而言，鸡舍越脏，所需药液量也越多。消毒鸡舍时所散布的药液量不能省。
五、带鸡喷雾消毒
因为鸡体本身携带、排出、传播病原微生物，加上外界病原微生物难免也会通过人体、饲料的携带和空气的传播等途径随时进入鸡舍，所以有必要带鸡消毒以消除疾病隐患。方法：刚出孵化场的初生雏在进入育雏室之前须进行一次全身性喷雾消毒，育雏期每日喷雾消毒一次，育成期每2日一次，产蛋期每3～5日一次。消毒期间须注意①鸡舍勤打扫，及时清除粪便、污物及灰尘，以免降低消毒质量；②喷雾程度以地面、墙壁、屋顶均匀湿润和鸡体表稍湿为好；③稀释消毒液用的水温要适当，应提前加热到室温；④喷雾造成鸡舍、鸡体表潮湿，消毒后要开窗通气，促其尽快干燥；⑤喷雾时室温比平时温度提高3-4℃，使被喷湿的鸡体得到适宜的温度，以免受冷挤堆压死；⑥各类消毒剂交替使用，每月轮换一次；⑦鸡群接种疫苗前后3天内停止喷雾消毒。
六、饮水消毒：要准确掌握好浓度
选择饮水用消毒剂须注意以下几点：①对病原体有强大杀灭作用；②长期使用无毒副作用；③适口性好；④不会在肉蛋中残留；⑤无致癌、致畸、致突变性。例如选择漂白粉、新洁尔灭、百毒杀等。另外，在进行饮水免疫前后各3天应停止饮水消毒，水槽不能用消毒剂清洗。
七、孵化消毒
1 种蛋消毒
在每天收集种蛋时，要及时剔除被粪便污染的种蛋，然后在舍内的消毒箱中用甲醛一高锰酸钾熏蒸消毒或固体甲醛熏蒸消毒。种蛋装入孵化器后，在开机前再消毒1次。种蛋孵化至第19天进入出雏阶段，由孵化器将种蛋倒入出雏器后，再进行1次消毒。
2 出雏阶段的消毒
当鸡雏破壳出雏达10-15％时，开始用福尔马林熏蒸消毒，在出雏率达到90％左右时熏蒸消毒，使用过氧化物类、氯制剂类等消毒药物喷雾消毒。
3 孵化器、出雏器及孵化用具的消毒
孵化器、出雏器、孵化用具在每次用后要进行彻底清洗、刷拭干净，经严格的消毒后待用。消毒药品可选用氯制剂类。
八、粪便消毒
鸡粪、垃圾应及时清除，并运至远离鸡场的指定地方，采用发酵法或堆粪法进行消毒。
九、工作人员消毒
鸡场工作人员在进入生产区之前，必须更换消毒过的工作服及胶鞋等，并在紫外线灯下消毒10分钟左右后，方可进入鸡场。鸡舍门口设有脚踏消毒槽，其宽度与门宽度一致，水深没过鞋面。门内设洗手盆。
十、对入场的车辆进行消毒
场区门口设置火碱池，对入场的车辆轮胎进行消毒。门口内设消毒水泵，用无腐蚀性的消毒剂对入场车辆的车体进行喷雾消毒。
十一、对外来人员进行消毒
门口设置更衣室，并安装紫外消毒装置。非生产人员及外来人员，未经允许不得进入生产区；必须进入生产区时，要更换消毒过的防护服、鞋、帽，方可进入场区。