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根据大地构造单元及地质背景条件与磷矿特征，秦岭地区划分４个成磷区，即华北、秦岭、扬子与摩天岭区。磷矿主要形成于晚震旦世和早寒武世。其间发育着不同岩石，构成各种类型矿石。磷矿的形成与陆源物质、有机质及铀矿关系密切。磷矿层处于“继承陆源碎屑”建造或“造海蒸发岩碳酸盐”建造中，特别是两种建造过渡带。矿床形成在地壳比较平静时期与造海运动关系密切。在扬子区北缘磷矿床通常赋存于“古地形高地”或“水下隆起”周围，常呈带状。扬子地台区北缘（摩天岭区）比华北地台南缘对子磷矿床形成更为有利。