水稻14-3-3蛋白家族的生物信息学分析

来源 :遗传学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：sophia_hou

【摘要】

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通过隐马尔柯夫模型(Hidden Markov Model,HMM),对粳稻(Oryza sativa L.ssp.japonica)基因组的蛋白质数据库进行搜索,结果获得8个14-3-3蛋白的同源序列,其中发现4个新基因.通

【作者】

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金谷雷汪旭升朱军

【机构】

：

浙江大学生物信息学研究所

【出处】

：

遗传学报

【发表日期】

：

2005年7期

【关键词】

：

14-3-3蛋白生物信息学分析家族隐马尔柯夫模型 Markov 蛋白质数据库表达序列标签 Model DNA序列染色体定位水稻基因组同源序列 ES

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通过隐马尔柯夫模型(Hidden Markov Model,HMM),对粳稻(Oryza sativa L.ssp.japonica)基因组的蛋白质数据库进行搜索,结果获得8个14-3-3蛋白的同源序列,其中发现4个新基因.通过对所有粳稻的14-3-3蛋白的DNA序列与各种表达序列标签(Expression Sequence Tags,ESTs)进一步比对,为14-3-3蛋白找到了ESTs的证据.结果说明这些基因在水稻不同的处理和不同的部位都有所表达,而且不同成员之间的表达模式存在较大的差异.蛋白质多序列

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