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以宗教改革为导火索,西南方及东北方的教派分裂日益明显,继而引发了神学院体系的门户之争。在德意志神圣罗马帝国(亦即今日的黑森州、萨克森州、勃莱登、普鲁士和威尔腾堡,以及瑞士大部分地区及其他城邦王国地区)的地区贵族和教会势力影响下,同时受到基督新教王国(今日的英格兰、瑞典、丹麦和荷兰)的势力渗透,逐渐产生了路德派新教学院。然而在天主教地区(诸如罗马城邦国家,“天主教至上的”西班牙,以奥地利为中心的哈布斯堡帝国,巴伐利亚,德意志教区,及诸多由神职人员所统治的城邦小国),罗马天主教的影响依然很强大。在西班牙哈布斯