为查明造成不同基质结构人工湿地净化性能差异的微生物因素,利用高通量测序技术,研究水平潜流人工湿地基质结构与微生物群落结构的相关性.结果表明,3个对比人工湿地系统中,从床体表层到底层渗透系数逐渐升高的六层结构人工湿地（CW6）净化性能最高,其出水中COD、TN、NO-3-N及NH₄⁺-N平均浓度分别为39、11、0.35及4 mg·L^-1,其后为三层结构人工湿地（CW3）,而单层结构人工湿地（CW1）的净化效果最差,平均出水浓度分别为95、21、0.60及12 mg·L^-1.高通量测序结果显示,多层结构人工湿地中微生物OTUs略低于单层结构湿地,但其优势菌门变形菌门（Proteobacteria）和其属水平上的硝化与反硝化细菌的相对丰度却显著高于单层湿地.PCA和丰度热图分析结果显示,CW3和CW6床体中变形菌门（Proteobacteria）属水平上的微生物存在显著的空间分布差异,从而有利于污染物的分区降解,而CW1各样点间的微生物群落结构无显著性差异.