A型口蹄疫病毒（FMDV）VP1基因遗传进化分析

来源 :四川大学学报：自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：beilei

【摘要】

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对疑似感染FMDV的样本进行了FMDV VP1基因RT-PCR鉴定,测定了其中1个阳性样本序列（命名为HY）.采用生物信息学软件比较了HY与参考序列的同源性,并构建VP1基因的分子系统树.结果表

【作者】

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杨江范辰韵高文倩罗晓林安添午庞倩许路来徐岳松

【机构】

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四川大学生命科学学院,四川省草原科学研究院

【出处】

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四川大学学报：自然科学版

【发表日期】

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2016年2期

【关键词】

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口蹄疫病毒 VP1 A型进化树分析 Foot-and-mouth disease virus VP1 Serotype A Phylogenetic a

【基金项目】

：

四川省科技支撑计划（2012NZ0047）, 四川省科技基础条件平台项目（14010136）, 国家自然科学基金项目（J1103518）

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对疑似感染FMDV的样本进行了FMDV VP1基因RT-PCR鉴定,测定了其中1个阳性样本序列（命名为HY）.采用生物信息学软件比较了HY与参考序列的同源性,并构建VP1基因的分子系统树.结果表明：HY属A型FMDV亚洲拓扑型东南亚-97谱系,与我国近年来报道的A/GDMM/CHA/2013的序列相似性为99.1%,与AF/72疫苗株的相似性仅为79.0%.提示我国近年来报道的A型毒株与AF/72疫苗株的序列差异较大,应及时更换A型口蹄疫疫苗毒株.

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