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本文基于马氏珠母贝（Pinctada fucata）血细胞比较转录组学数据进行单核苷酸多态性标记（SNP）的开发和关联基因的功能注释分析，以期为SNP标记的利用提供有效信息。在转录组测序获得的67632条SNP．unigenes中共获得962995个SNP位点，位点平均发生频率约为1个SNP／100bp；转换SNP数目与颠换SNP数目比值约为0．5，与理论比率相符；而6种单核苷酸变异类型中，以A／T颠换SNP最多。SNP．unigene功能注释分析表明，30376条unigenes（44．91％）匹配到G