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东北虎源犬瘟热病毒H基因生物信息学分析!

来源 :经济动物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ma_mwj

【摘 要】

：

从Gen Bank数据库下载犬瘟热病毒14种基因型H基因237株序列,与3株东北虎源犬瘟热病毒序列比对之后进行同源性和位点变异分析,最后构建系统发育树。研究发现：3株东北虎源犬瘟热

【作 者】

：

江峰 王昊宁 黄利亚 王晓龙 

【机 构】

：

东北林业大学野生动物资源学院,东北林业大学保护医学与生态安全研究中心,长白山科学研究院

【出 处】

：

经济动物学报

【发表日期】

：

2018年1期

【关键词】

：

犬瘟热病毒 东北虎 H基因 基因型 位点变异 canine distemper virus Amur tiger H gene genotype site mu 

【基金项目】

：

国家重点研发计划专项（2017YFD0501702）

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从Gen Bank数据库下载犬瘟热病毒14种基因型H基因237株序列,与3株东北虎源犬瘟热病毒序列比对之后进行同源性和位点变异分析,最后构建系统发育树。研究发现：3株东北虎源犬瘟热病毒（KC579362、KC579363和KM386683）分别属于Arctic-like和Asia-1基因型,与其他基因型毒株的同源性为89.94%~100%之间,H基因序列1 632（G→A）、1 664（C→T）、1 729（G→A）和1 795（G→A）位点的突变可能是CDV跨宿主传播给东北虎的关键突变位点。Arctic

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