【摘 要】
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本研究采用高通量测序技术(Illumina Hiseq TM2000)首次对世界名贵园林花卉马缨杜鹃（Rhododendron delavayi）进行了基因组大小的测定,并评估了马缨杜鹃的GC含量、杂合率和序列
【机 构】
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云南省农业科学院花卉研究所; 国家观赏园艺工程技术研究中心; 云南省花卉育种重点实验室;
【基金项目】
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云南省应用基础研究计划(2016FB058);云南省花卉育种重点实验室开放基金(FKL-201501);云南省科技计划(2015BB013);国家自然科学基金(31460217;31560225)共同资助
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本研究采用高通量测序技术(Illumina Hiseq TM2000)首次对世界名贵园林花卉马缨杜鹃（Rhododendron delavayi）进行了基因组大小的测定,并评估了马缨杜鹃的GC含量、杂合率和序列重复度等信息参数,为马缨杜鹃全基因组测序策略的选择提供了有据参考。全基因组扫描结果如下:马缨杜鹃的基因组大小约为698 Mb,杂合率较高约为1.25%,GC含量约为39%,且具有一定的基因组序列重复度。研究表明:马缨杜鹃的全基因组测序分析不宜采用全基因组鸟枪法（WGS）,可尝试WGS与fosmid或BAC-to-BAC相结合的测序策略,亦或采用杂合组装软件进行序列拼装,以提高全基因组序列的拼装质量。
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