目的探究在小儿感染性疾病中降钙素原和C反应蛋白的临床应用效果和临床意义。方法选取2014年10月-2015年2月在我院儿科进行感染性疾病治疗的患者160例,根据患儿的感染类型分为细菌性(82例)和病毒性感染(78例),对患者的血清降钙素原及C反应但被进行相关分析。结果血清中降钙素原的指标显示病毒性感染患者阳性率为14.1%,而细菌性感染患者的阳性率为92.7%(降钙素原为阳性的判断标准为含量>0.05μg/L),C反应蛋白数据显示,病毒性感染组C反应蛋白的阳性率为35.9%,而细菌性感染患者的阳性率为20.7%(C反应蛋白阳性的判断标准为含量>10 mg/L)。结论在小儿的感染性疾病的判断中,运用血清降钙素检测效果优于C反应蛋白,其可作为判断病毒性和感染性疾病的诊断标准。