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医学院校思想政治教育生态理念包括“以人为本”的生态理念、“和谐共生”的育人理念、“厚德载物”的包容理念和“道法自然”的修养理念等。树立思想政治教育生态理念，关注医学教育对象本身和思想政治育人规律的研究，有助于克服传统思想政治教育的非生态性和非主体性，优化医学院校思想政治育人环境，从而建构以医学生个体生命和内在价值为核心的思想政治教育生态评价理念和机制。