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评价腐熟度是有关堆肥土地安全利用最重要的问题之一。腐熟度指标可分为三类：物理学指标、化学指标及生物学指标。物理学指标易于检测，常用于描述堆肥过程所处的状态；化学指标得到了广泛研究和应用；堆肥过程是一个生物过程，腐熟度与未腐熟堆肥中植物毒性物质有关，可采用生物学方法进行评价。现在还没有一种公认的堆肥腐熟度指标。采用化学和生物指标综合评价腐熟度是目前最为常用的评价方法。