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科学与宗教的关系是科学史中很有争议的主题.非基督教运动期间,反基督教思潮和科学思潮促成了一场规模空前的科学与宗教论战.在论战中,“非基督教”学者与“护基督教”学者围绕“宗教是否违背科学精神”“宗教是否阻碍科学发展”和“宗教是否阻碍科学在中国的传播与进步”三个主题展开激烈争论.论战加速了科学在中国的传播和普及,促进了教会教育的世俗化,强化了“科学”在中国的地位,其影响一直至今.