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跨物种的生物序列比较已经被广泛应用丁基因功能预测，而越来越多的实验表明序列相似性并不足以保证基因功能相似．为了精确确定基因功能，不仅需要考虑序列性质，还需探索基因表达信息的特性，因为基因表达的改变往往伴随着基因功能的改变．通过聚类分析基因表达谱，可以卣观判断协同表达基因及其规律，这是考察基闪功能的重要一步．由于生物组织基因表达的复杂性，以及识别表达的microarray技术和理念的不断更新，表达数据的规模也呈指数规律递增，聚类分析遭遇了巨大瓶颈——过高的时空复杂度．根据“基因表达谱”的数据特征，对处理表达