基于贪婪算法的疾病相关蛋白质子网搜索

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各种研究结果不断证明,人类各种常见疾病都属于复杂疾病,是由多基因、多因素、遗传和环境共同作用的结果。借助于高通量生物技术的飞速发展.生物学家建立起了蛋白交互网络,如果借助复杂网络研究的方法。从这些网络中找出与疾病相关的蛋白质子网络,将有助于我们更深入地了解生物体的运作机制。本文提出了一种基于贪婪算法的搜索方法,能够自动地搜索整个网络中的子网或模块,并且能够结合芯片数据同时进行T检验来判断子网络对疾病表型的区分能力。通过计算子网的P值.给出该蛋白质子网络的统计显著性值并进行区分能力排序。运行结果表明,本方法
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