鲍曼不动杆菌噬菌体SWH-Ab-3的生物学特性及其全基因组初步研究

来源 :第三军医大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:redkind
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目的 从医院污水中分离鲍曼不动杆菌裂解性噬菌体,探讨其生物学特性及基因组基本信息.方法 以临床分离的鲍曼不动杆菌为指示菌,采用双层琼脂平板法分离、纯化噬菌体,观察噬菌斑特征;利用透射电子显微镜观察噬菌体的形态特征;采用点板试验测定噬菌体的裂菌谱,并观察其最佳感染复数(MOI)、一步生长曲线以及对热、酸碱等理化因素的耐受性.提取噬菌体全基因组DNA,采用Illumina Hiseq2000高通量测序,并对其基因组序列进行注释、比对分析.结果 从污水中成功分离出1株鲍曼不动杆菌的裂解性噬菌体,命名为SWH-Ab-3;噬菌体头部直径约为70 nm,尾长约80 nm,初步判断其属肌尾噬菌体科;该噬菌体裂菌谱较窄(6株/42株),最佳感染复数为0.1,潜伏期为40 min,爆发期为50 min,裂解量为31.4 PFU/cell,对热和酸碱环境的耐受性较高.SWH-Ab-3基因组长度为41730 bp,G+C%含量为39.38%,共编码53个ORF(33个已知功能基因,20个假想蛋白),其序列与Abp1和vB_AbaP_B3的同源性最高(≥94.0%),但基因组长度、G+C%含量和形态特征差异显著.结论SWH-Ab-3为1株新分离的鲍曼不动杆菌裂解性噬菌体,属肌尾噬菌体科,对热、酸碱等理化因素较耐受,可能通过穿孔素和裂解酶组成的"二元裂解系统"发挥裂菌作用,裂解能力较强,但裂菌谱较窄.
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