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采用单因子试验，研究引物、dNTPs、Mg2＋、Taq DNA聚合酶及退火温度对PCR扩增的影响，用其建立优化四倍体菘蓝的ISSR—PCR反应体系，分析不向四倍体菘蓝株系的遗传差异性。结果发现ISSR—PCR最佳反应体系为：在25μL的反应体系中，引物浓度为0．76μmol／L，dNTPs浓度为190μmol／L，MgCl2浓度为200μmol／L，Taq DNA聚合酶用量为1．5u，模板DNA浓度为20ng／μL；确定了不同引物最佳退火温度；菘蓝株系间具有中等偏高的遗传差异性，多态性条带达58．22％。