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美国肝素钠注射剂标签已被加上延长发生肝素引起的血小板减少症的危险警告。血小板减少可能源于静脉和动脉血栓形成。血小板减少可能在停用肝素后数周发生，连带严重血栓事件包括深静脉血栓、肺栓塞、脑静脉血栓、肢体缺血、卒中、心肌梗死、肠系膜血栓、肾动脉血栓、皮肤坏死、肢体坏疽等，均可导致残废或者死亡。故血小板计数低于10万·mm^-3或再发血栓的患者，应立即停用肝素并考虑使用其他替代抗凝剂。