基于高通量测序技术的濒危植物黄瑞香Daphne giraldii Nitsche根部内生真菌多样性研究

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通过研究濒危植物黄瑞香根部真菌种类的多样性,为濒危植物黄瑞香真菌库的建立及筛选促进黄瑞香生长和提高其活性成分祖师麻甲素含量的内生真菌提供科学依据.以甘肃、山西两省的9份野生黄瑞香植株为研究对象,利用Illumina高通量测序技术对其测序并进行生物信息学分析,共获得632 766条有效序列,包括348个OTU,4门,20纲,48目,108科,154属,208种,丰度占比前3的真菌属之和能够占到总丰度的65%以上,最高可以达到98.4%,链格孢属(Altemaria)、茎点霉属(Phoma)为黄瑞香的核心菌属,链格孢属为优势属;黄瑞香根部内生真菌多样性丰富,不同产区内生真菌多样性依次为:甘谷县>五台县>宕昌县.
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