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推导出存在上位性互作的两对连锁基因在F2群体中各表型的概率和条件概率以便利用EM(expectation and maximization:期望最大化)算法估计重组率，还获得了重组率的标准误公式。通过Monte Carlo模拟发现：用EM算法和Fisher法估计重组率时其结果一致；前者易推广到两基因间具有上位性互作的情形，模拟显示其无偏性好。