醛固酮腺瘤的关键基因及其生物学功能的生物信息学分析

来源 :中华内分泌代谢杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bd05082052
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的

通过生物信息学分析探讨醛固酮腺瘤的关键基因及其相关的生物学功能。

方法

从GEO数据库2个训练数据集GSE60042和GSE64957鉴定出醛固酮腺瘤差异表达基因,并进行功能、通路富集和转录调控网络分析;使用差异表达基因构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,通过节点分析从网络中提取枢纽(Hub)基因作为候选关键基因;以测试数据集GSE8514验证关键基因的表达水平;以受试者工作特征(ROC)曲线分析验证关键基因对醛固酮腺瘤的诊断效能;使用基因集富集分析(GSEA)确定各关键基因的生物学功能。

结果

从2个数据集获得醛固酮腺瘤中68个差异基因,包括33个上调基因和35个下调基因,这些基因功能体现在醛固酮生物合成过程、细胞内钙信号通路、5-羟色胺受体信号通路、转录激活因子活性和转录调控等方面;转录因子-基因调控网络中JUN和VDR基因处于中心位置。从PPI网络确定了9个Hub基因,在测试数据集,CYP11B2、VDR基因在醛固酮腺瘤中的表达升高,而JUN、NFKBIZ、EGR3、KLF6基因在醛固酮腺瘤中的表达降低(均P

其他文献
会议
期刊
期刊
期刊
期刊
会议
期刊
期刊
学位
学位